В 2014 на фоне конфликта с главой церкви священнослужителя отстранили от служения. Но он продолжил свою деятельность и в январе 2015 основал независимую церковь, которая известна как Церковь Христа Доброго Пастыря.
Мари Эммануэль ежегодно посещает США, выступает перед верующими и проповедует в других общинах, которые откололись от основных церквей. Эммануэль обладает интернет-популярностью в правых сообществах по всему миру, благодаря проповедям в своих соцсетях. Он говорит о том, что в католическую церковь проник дьявол, открыто критикует ислам и иудаизм, распространение ЛГБТ*. Сегодня во время его проповеди в Сиднее на него напал неизвестный с ножом, всего ранения получили 4 человека, в данный момент священнослужитель находится в стабильном состоянии.
